Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.46□□□□□ -0.73
YBL055CP34220 PHO89YBR296C 1725 nt10.45□□□□□ -0.74
YBL055CP34220 POM34YLR018C 900 nt10.45□□□□□ -0.74
YBL055CP34220 MSF1YPR047W 1410 nt10.44□□□□□ -0.74
YBL055CP34220 YSR3YKR053C 1215 nt10.43□□□□□ -0.74
YBL055CP34220 GAP1YKR039W 1809 nt10.42□□□□□ -0.74
YBL055CP34220 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.41□□□□□ -0.74
YBL055CP34220 TOM6YOR045W 186 nt10.4□□□□□ -0.74
YBL055CP34220 PRM5YIL117C 957 nt10.39□□□□□ -0.75
YBL055CP34220 UTR1YJR049C 1593 nt10.39□□□□□ -0.75
YBL055CP34220 ATG15YCR068W 1563 nt10.38□□□□□ -0.75
YBL055CP34220 XYL2YLR070C 1071 nt10.37□□□□□ -0.75
YBL055CP34220 YML089CYML089C 369 nt10.37□□□□□ -0.75
YBL055CP34220 CMP2YML057W 1815 nt10.36□□□□□ -0.75
YBL055CP34220 COQ2YNR041C 1119 nt10.36□□□□□ -0.75
YBL055CP34220 YGL034CYGL034C 366 nt10.34□□□□□ -0.75
YBL055CP34220 YCR087WYCR087W 516 nt10.32□□□□□ -0.76
YBL055CP34220 MRP20YDR405W 792 nt10.32□□□□□ -0.76
YBL055CP34220 YAT1YAR035W 2064 nt10.31□□□□□ -0.76
YBL055CP34220 PEX2YJL210W 816 nt10.31□□□□□ -0.76
YBL055CP34220 HIF1YLL022C 1158 nt10.3□□□□□ -0.76
YBL055CP34220 ALD4YOR374W 1560 nt10.3□□□□□ -0.76
YBL055CP34220 TIF6YPR016C 738 nt10.28□□□□□ -0.76
YBL055CP34220 HIP1YGR191W 1812 nt10.27□□□□□ -0.77
YBL055CP34220 AIM45YPR004C 1035 nt10.26□□□□□ -0.77
YBL055CP34220 DIF1YLR437C 402 nt10.25□□□□□ -0.77
YBL055CP34220 SAM35YHR083W 990 nt10.24□□□□□ -0.77
YBL055CP34220 NDI1YML120C 1542 nt10.23□□□□□ -0.77
YBL055CP34220 RPL4BYDR012W 1089 nt10.21□□□□□ -0.77
YBL055CP34220 RBG1YAL036C 1110 nt10.21□□□□□ -0.77
YBL055CP34220 RPL4AYBR031W 1089 nt10.21□□□□□ -0.77
YBL055CP34220 MET28YIR017C 564 nt10.2□□□□□ -0.78
YBL055CP34220 CLB6YGR109C 1143 nt10.18□□□□□ -0.78
YBL055CP34220 UTH1YKR042W 1098 nt10.18□□□□□ -0.78
YBL055CP34220 NRT1YOR071C 1797 nt10.18□□□□□ -0.78
YBL055CP34220 RPS14BYJL191W 417 nt10.16□□□□□ -0.78
YBL055CP34220 YAR028WYAR028W 705 nt10.14□□□□□ -0.79
YBL055CP34220 HSL7YBR133C 2484 nt10.13□□□□□ -0.79
YBL055CP34220 SPT20YOL148C 1815 nt10.12□□□□□ -0.79
YBL055CP34220 DBP1YPL119C 1854 nt10.11□□□□□ -0.79
YBL055CP34220 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.09□□□□□ -0.79
YBL055CP34220 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.09□□□□□ -0.79
YBL055CP34220 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.09□□□□□ -0.79
YBL055CP34220 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.09□□□□□ -0.79
YBL055CP34220 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.09□□□□□ -0.79
YBL055CP34220 HXT1YHR094C 1713 nt10.09□□□□□ -0.79
YBL055CP34220 MTG2YHR168W 1557 nt10.09□□□□□ -0.79
YBL055CP34220 INA1YLR413W 2028 nt10.09□□□□□ -0.79
YBL055CP34220 RPC82YPR190C 1965 nt10.07□□□□□ -0.8
YBL055CP34220 FIT3YOR383C 615 nt10.06□□□□□ -0.8
YBL055CP34220 ZTA1YBR046C 1005 nt10.06□□□□□ -0.8
YBL055CP34220 ZRT3YKL175W 1512 nt10.06□□□□□ -0.8
YBL055CP34220 SED1YDR077W 1017 nt10.05□□□□□ -0.8
YBL055CP34220 LIP1YMR298W 453 nt10.05□□□□□ -0.8
YBL055CP34220 AKR2YOR034C 2250 nt10.05□□□□□ -0.8
YBL055CP34220 ALP1YNL270C 1722 nt10.04□□□□□ -0.8
YBL055CP34220 YBL086CYBL086C 1401 nt10.02□□□□□ -0.81
YBL055CP34220 SHY1YGR112W 1170 nt10.01□□□□□ -0.81
YBL055CP34220 TSC10YBR265W 963 nt10□□□□□ -0.81
YBL055CP34220 SDH5YOL071W 489 nt9.99□□□□□ -0.81
YBL055CP34220 SBA1YKL117W 651 nt9.97□□□□□ -0.81
YBL055CP34220 YLR279WYLR279W 390 nt9.97□□□□□ -0.81
YBL055CP34220 YJL067WYJL067W 351 nt9.96□□□□□ -0.82
YBL055CP34220 YGR012WYGR012W 1182 nt9.95□□□□□ -0.82
YBL055CP34220 GLR1YPL091W 1452 nt9.95□□□□□ -0.82
YBL055CP34220 SAM1YLR180W 1149 nt9.94□□□□□ -0.82
YBL055CP34220 YPL251WYPL251W 303 nt9.94□□□□□ -0.82
YBL055CP34220 LEU9YOR108W 1815 nt9.93□□□□□ -0.82
YBL055CP34220 BRR1YPR057W 1026 nt9.93□□□□□ -0.82
YBL055CP34220 MSB4YOL112W 1479 nt9.92□□□□□ -0.82
YBL055CP34220 TOA2YKL058W 369 nt9.91□□□□□ -0.82
YBL055CP34220 UFO1YML088W 2007 nt9.89□□□□□ -0.83
YBL055CP34220 URA6YKL024C 615 nt9.89□□□□□ -0.83
YBL055CP34220 RPM1RPM1 483 nt9.88□□□□□ -0.83
YBL055CP34220 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.88□□□□□ -0.83
YBL055CP34220 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.88□□□□□ -0.83
YBL055CP34220 GND2YGR256W 1479 nt9.87□□□□□ -0.83
YBL055CP34220 YMR244WYMR244W 1068 nt9.87□□□□□ -0.83
YBL055CP34220 RAD23YEL037C 1197 nt9.86□□□□□ -0.83
YBL055CP34220 MEP3YPR138C 1470 nt9.85□□□□□ -0.83
YBL055CP34220 YMR103CYMR103C 363 nt9.85□□□□□ -0.83
YBL055CP34220 YLR111WYLR111W 333 nt9.84□□□□□ -0.83
YBL055CP34220 UGA4YDL210W 1716 nt9.84□□□□□ -0.83
YBL055CP34220 RIM8YGL045W 1629 nt9.83□□□□□ -0.84
YBL055CP34220 CAB5YDR196C 726 nt9.83□□□□□ -0.84
YBL055CP34220 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.83□□□□□ -0.84
YBL055CP34220 OYE3YPL171C 1203 nt9.83□□□□□ -0.84
YBL055CP34220 MUP1YGR055W 1725 nt9.82□□□□□ -0.84
YBL055CP34220 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.81□□□□□ -0.84
YBL055CP34220 HEL2YDR266C 1920 nt9.8□□□□□ -0.84
YBL055CP34220 PET8YNL003C 855 nt9.79□□□□□ -0.84
YBL055CP34220 RIB3YDR487C 627 nt9.78□□□□□ -0.84
YBL055CP34220 FCY21YER060W 1587 nt9.78□□□□□ -0.84
YBL055CP34220 YMR226CYMR226C 804 nt9.77□□□□□ -0.85
YBL055CP34220 HOL1YNR055C 1761 nt9.76□□□□□ -0.85
YBL055CP34220 CWC15YDR163W 528 nt9.75□□□□□ -0.85
YBL055CP34220 YGL114WYGL114W 2178 nt9.75□□□□□ -0.85
YBL055CP34220 APT2YDR441C 546 nt9.74□□□□□ -0.85
YBL055CP34220 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.74□□□□□ -0.85
YBL055CP34220 SAM2YDR502C 1155 nt9.73□□□□□ -0.85
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