Protein–RNA interactions for Protein: P25037

UBP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP1P25037 YCR102CYCR102C 1107 nt12.7□□□□□ -0.38
UBP1P25037 SEC11YIR022W 504 nt12.69□□□□□ -0.38
UBP1P25037 AVT6YER119C 1347 nt12.66□□□□□ -0.38
UBP1P25037 TIM44YIL022W 1296 nt12.64□□□□□ -0.39
UBP1P25037 HHO1YPL127C 777 nt12.64□□□□□ -0.39
UBP1P25037 LYS4YDR234W 2082 nt12.64□□□□□ -0.39
UBP1P25037 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt12.63□□□□□ -0.39
UBP1P25037 PCH2YBR186W 1695 nt12.63□□□□□ -0.39
UBP1P25037 NRT1YOR071C 1797 nt12.61□□□□□ -0.39
UBP1P25037 GOR1YNL274C 1053 nt12.59□□□□□ -0.39
UBP1P25037 HIP1YGR191W 1812 nt12.55□□□□□ -0.4
UBP1P25037 GUT2YIL155C 1950 nt12.54□□□□□ -0.4
UBP1P25037 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.54□□□□□ -0.4
UBP1P25037 TIR3YIL011W 810 nt12.52□□□□□ -0.41
UBP1P25037 RIB1YBL033C 1038 nt12.52□□□□□ -0.41
UBP1P25037 YBR232CYBR232C 360 nt12.52□□□□□ -0.41
UBP1P25037 PEX2YJL210W 816 nt12.51□□□□□ -0.41
UBP1P25037 TOM6YOR045W 186 nt12.51□□□□□ -0.41
UBP1P25037 YJL064WYJL064W 396 nt12.5□□□□□ -0.41
UBP1P25037 LOT5YKL183W 921 nt12.5□□□□□ -0.41
UBP1P25037 RAX1YOR301W 1308 nt12.5□□□□□ -0.41
UBP1P25037 PGC1YPL206C 966 nt12.49□□□□□ -0.41
UBP1P25037 AAC1YMR056C 930 nt12.48□□□□□ -0.41
UBP1P25037 GND1YHR183W 1470 nt12.47□□□□□ -0.41
UBP1P25037 MSB4YOL112W 1479 nt12.47□□□□□ -0.41
UBP1P25037 MET28YIR017C 564 nt12.47□□□□□ -0.41
UBP1P25037 PAU19YMR325W 375 nt12.47□□□□□ -0.41
UBP1P25037 NCP1YHR042W 2076 nt12.47□□□□□ -0.41
UBP1P25037 PAU5YFL020C 369 nt12.45□□□□□ -0.42
UBP1P25037 STP3YLR375W 1032 nt12.45□□□□□ -0.42
UBP1P25037 YML089CYML089C 369 nt12.45□□□□□ -0.42
UBP1P25037 SHH4YLR164W 507 nt12.43□□□□□ -0.42
UBP1P25037 SLG1YOR008C 1137 nt12.42□□□□□ -0.42
UBP1P25037 FIT3YOR383C 615 nt12.42□□□□□ -0.42
UBP1P25037 ERG6YML008C 1152 nt12.39□□□□□ -0.43
UBP1P25037 POM34YLR018C 900 nt12.38□□□□□ -0.43
UBP1P25037 BMT6YLR063W 1098 nt12.36□□□□□ -0.43
UBP1P25037 NBP35YGL091C 987 nt12.34□□□□□ -0.43
UBP1P25037 SOD2YHR008C 702 nt12.34□□□□□ -0.43
UBP1P25037 TIF6YPR016C 738 nt12.34□□□□□ -0.43
UBP1P25037 YIA6YIL006W 1122 nt12.33□□□□□ -0.44
UBP1P25037 APT2YDR441C 546 nt12.32□□□□□ -0.44
UBP1P25037 RTF1YGL244W 1677 nt12.32□□□□□ -0.44
UBP1P25037 LSC2YGR244C 1284 nt12.29□□□□□ -0.44
UBP1P25037 QDR2YIL121W 1629 nt12.29□□□□□ -0.44
UBP1P25037 BOP3YNL042W 1191 nt12.28□□□□□ -0.44
UBP1P25037 LSB3YFR024C-A 1380 nt12.27□□□□□ -0.45
UBP1P25037 PIB2YGL023C 1908 nt12.25□□□□□ -0.45
UBP1P25037 DUT1YBR252W 444 nt12.25□□□□□ -0.45
UBP1P25037 ATG15YCR068W 1563 nt12.23□□□□□ -0.45
UBP1P25037 PRO1YDR300C 1287 nt12.23□□□□□ -0.45
UBP1P25037 RIB2YOL066C 1776 nt12.21□□□□□ -0.45
UBP1P25037 SMM1YNR015W 1155 nt12.19□□□□□ -0.46
UBP1P25037 TIP1YBR067C 633 nt12.19□□□□□ -0.46
UBP1P25037 POP2YNR052C 1302 nt12.17□□□□□ -0.46
UBP1P25037 ALD4YOR374W 1560 nt12.13□□□□□ -0.47
UBP1P25037 AGP1YCL025C 1902 nt12.11□□□□□ -0.47
UBP1P25037 HXT12YIL170W 1374 nt12.1□□□□□ -0.47
UBP1P25037 PAR32YDL173W 888 nt12.07□□□□□ -0.48
UBP1P25037 PTK1YKL198C 1989 nt12.07□□□□□ -0.48
UBP1P25037 YER152W-AYER152W-A 567 nt12.06□□□□□ -0.48
UBP1P25037 CCT5YJR064W 1689 nt12.06□□□□□ -0.48
UBP1P25037 TAF13YML098W 504 nt12.05□□□□□ -0.48
UBP1P25037 ALP1YNL270C 1722 nt12.05□□□□□ -0.48
UBP1P25037 FCY21YER060W 1587 nt12.05□□□□□ -0.48
UBP1P25037 YJL225CYJL225C 5277 nt12.04□□□□□ -0.48
UBP1P25037 VRG4YGL225W 1014 nt12.03□□□□□ -0.48
UBP1P25037 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.98□□□□□ -0.49
UBP1P25037 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.98□□□□□ -0.49
UBP1P25037 CSM2YIL132C 642 nt11.98□□□□□ -0.49
UBP1P25037 YCP4YCR004C 744 nt11.97□□□□□ -0.49
UBP1P25037 AQY2YLL052C 450 nt11.97□□□□□ -0.49
UBP1P25037 BUD20YLR074C 501 nt11.97□□□□□ -0.49
UBP1P25037 YAR028WYAR028W 705 nt11.97□□□□□ -0.49
UBP1P25037 PRY1YJL079C 900 nt11.95□□□□□ -0.5
UBP1P25037 CCA1YER168C 1641 nt11.95□□□□□ -0.5
UBP1P25037 AKR2YOR034C 2250 nt11.95□□□□□ -0.5
UBP1P25037 THI72YOR192C 1800 nt11.94□□□□□ -0.5
UBP1P25037 YFL054CYFL054C 1941 nt11.93□□□□□ -0.5
UBP1P25037 GAP1YKR039W 1809 nt11.93□□□□□ -0.5
UBP1P25037 ZTA1YBR046C 1005 nt11.92□□□□□ -0.5
UBP1P25037 ARP6YLR085C 1317 nt11.9□□□□□ -0.5
UBP1P25037 UME6YDR207C 2511 nt11.9□□□□□ -0.5
UBP1P25037 DUS1YML080W 1272 nt11.9□□□□□ -0.5
UBP1P25037 STR3YGL184C 1398 nt11.89□□□□□ -0.51
UBP1P25037 MTG2YHR168W 1557 nt11.85□□□□□ -0.51
UBP1P25037 GSF2YML048W 1212 nt11.85□□□□□ -0.51
UBP1P25037 YMR262WYMR262W 942 nt11.85□□□□□ -0.51
UBP1P25037 YJL055WYJL055W 738 nt11.84□□□□□ -0.51
UBP1P25037 TUB4YLR212C 1422 nt11.84□□□□□ -0.51
UBP1P25037 KRE1YNL322C 942 nt11.81□□□□□ -0.52
UBP1P25037 DIF1YLR437C 402 nt11.8□□□□□ -0.52
UBP1P25037 SAM50YNL026W 1455 nt11.8□□□□□ -0.52
UBP1P25037 BOR1YNL275W 1731 nt11.77□□□□□ -0.53
UBP1P25037 TOS1YBR162C 1368 nt11.75□□□□□ -0.53
UBP1P25037 HSP60YLR259C 1719 nt11.74□□□□□ -0.53
UBP1P25037 POT1YIL160C 1254 nt11.74□□□□□ -0.53
UBP1P25037 RPL12BYDR418W 498 nt11.73□□□□□ -0.53
UBP1P25037 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.73□□□□□ -0.53
UBP1P25037 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 821.3 ms