Protein–RNA interactions for Protein: P0CX38

RPS6B, 40S ribosomal protein S6-B, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS6BP0CX38 TIR3YIL011W 810 nt10.93□□□□□ -0.66
RPS6BP0CX38 SFA1YDL168W 1161 nt10.91□□□□□ -0.66
RPS6BP0CX38 PRO1YDR300C 1287 nt10.9□□□□□ -0.66
RPS6BP0CX38 ARA2YMR041C 1008 nt10.9□□□□□ -0.66
RPS6BP0CX38 PRM5YIL117C 957 nt10.89□□□□□ -0.67
RPS6BP0CX38 POM34YLR018C 900 nt10.87□□□□□ -0.67
RPS6BP0CX38 UTR1YJR049C 1593 nt10.86□□□□□ -0.67
RPS6BP0CX38 CYT2YKL087C 675 nt10.86□□□□□ -0.67
RPS6BP0CX38 GAP1YKR039W 1809 nt10.86□□□□□ -0.67
RPS6BP0CX38 UBA4YHR111W 1323 nt10.85□□□□□ -0.67
RPS6BP0CX38 RET2YFR051C 1641 nt10.85□□□□□ -0.67
RPS6BP0CX38 LSC2YGR244C 1284 nt10.85□□□□□ -0.67
RPS6BP0CX38 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.85□□□□□ -0.67
RPS6BP0CX38 THI74YDR438W 1113 nt10.84□□□□□ -0.67
RPS6BP0CX38 YLR122CYLR122C 378 nt10.82□□□□□ -0.68
RPS6BP0CX38 TOM6YOR045W 186 nt10.81□□□□□ -0.68
RPS6BP0CX38 PHO89YBR296C 1725 nt10.81□□□□□ -0.68
RPS6BP0CX38 HIF1YLL022C 1158 nt10.8□□□□□ -0.68
RPS6BP0CX38 ATG15YCR068W 1563 nt10.77□□□□□ -0.68
RPS6BP0CX38 YSR3YKR053C 1215 nt10.77□□□□□ -0.69
RPS6BP0CX38 Q0010Q0010 387 nt10.77□□□□□ -0.69
RPS6BP0CX38 BUR6YER159C 429 nt10.75□□□□□ -0.69
RPS6BP0CX38 MSF1YPR047W 1410 nt10.75□□□□□ -0.69
RPS6BP0CX38 ALD4YOR374W 1560 nt10.74□□□□□ -0.69
RPS6BP0CX38 YAT1YAR035W 2064 nt10.74□□□□□ -0.69
RPS6BP0CX38 NAT4YMR069W 858 nt10.74□□□□□ -0.69
RPS6BP0CX38 COQ2YNR041C 1119 nt10.74□□□□□ -0.69
RPS6BP0CX38 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.72□□□□□ -0.69
RPS6BP0CX38 PEX2YJL210W 816 nt10.72□□□□□ -0.69
RPS6BP0CX38 XYL2YLR070C 1071 nt10.72□□□□□ -0.69
RPS6BP0CX38 YML089CYML089C 369 nt10.72□□□□□ -0.69
RPS6BP0CX38 DIF1YLR437C 402 nt10.69□□□□□ -0.7
RPS6BP0CX38 TIF6YPR016C 738 nt10.69□□□□□ -0.7
RPS6BP0CX38 HIP1YGR191W 1812 nt10.68□□□□□ -0.7
RPS6BP0CX38 LCP5YER127W 1074 nt10.67□□□□□ -0.7
RPS6BP0CX38 YGL034CYGL034C 366 nt10.67□□□□□ -0.7
RPS6BP0CX38 ABZ2YMR289W 1125 nt10.67□□□□□ -0.7
RPS6BP0CX38 YJR154WYJR154W 1041 nt10.66□□□□□ -0.7
RPS6BP0CX38 URH1YDR400W 1023 nt10.64□□□□□ -0.71
RPS6BP0CX38 MRP20YDR405W 792 nt10.62□□□□□ -0.71
RPS6BP0CX38 TOM20YGR082W 552 nt10.62□□□□□ -0.71
RPS6BP0CX38 YCR087WYCR087W 516 nt10.6□□□□□ -0.71
RPS6BP0CX38 SAM35YHR083W 990 nt10.6□□□□□ -0.71
RPS6BP0CX38 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.6□□□□□ -0.71
RPS6BP0CX38 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.6□□□□□ -0.71
RPS6BP0CX38 DBP1YPL119C 1854 nt10.59□□□□□ -0.71
RPS6BP0CX38 AIM45YPR004C 1035 nt10.59□□□□□ -0.71
RPS6BP0CX38 BMT5YIL096C 1011 nt10.57□□□□□ -0.72
RPS6BP0CX38 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.56□□□□□ -0.72
RPS6BP0CX38 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.56□□□□□ -0.72
RPS6BP0CX38 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.56□□□□□ -0.72
RPS6BP0CX38 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.56□□□□□ -0.72
RPS6BP0CX38 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.56□□□□□ -0.72
RPS6BP0CX38 MET28YIR017C 564 nt10.54□□□□□ -0.72
RPS6BP0CX38 SRN2YLR119W 642 nt10.54□□□□□ -0.72
RPS6BP0CX38 MTG2YHR168W 1557 nt10.53□□□□□ -0.72
RPS6BP0CX38 NRT1YOR071C 1797 nt10.53□□□□□ -0.72
RPS6BP0CX38 RPS14BYJL191W 417 nt10.53□□□□□ -0.72
RPS6BP0CX38 RBG1YAL036C 1110 nt10.53□□□□□ -0.72
RPS6BP0CX38 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.53□□□□□ -0.72
RPS6BP0CX38 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.53□□□□□ -0.72
RPS6BP0CX38 RPL4BYDR012W 1089 nt10.52□□□□□ -0.73
RPS6BP0CX38 AI5_BETAQ0075 1065 nt10.52□□□□□ -0.73
RPS6BP0CX38 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt10.52□□□□□ -0.73
RPS6BP0CX38 YAR028WYAR028W 705 nt10.52□□□□□ -0.73
RPS6BP0CX38 RPL4AYBR031W 1089 nt10.52□□□□□ -0.73
RPS6BP0CX38 RPC82YPR190C 1965 nt10.52□□□□□ -0.73
RPS6BP0CX38 HXT1YHR094C 1713 nt10.51□□□□□ -0.73
RPS6BP0CX38 ZTA1YBR046C 1005 nt10.51□□□□□ -0.73
RPS6BP0CX38 UTH1YKR042W 1098 nt10.5□□□□□ -0.73
RPS6BP0CX38 ZRT3YKL175W 1512 nt10.49□□□□□ -0.73
RPS6BP0CX38 YBL086CYBL086C 1401 nt10.49□□□□□ -0.73
RPS6BP0CX38 CMP2YML057W 1815 nt10.48□□□□□ -0.73
RPS6BP0CX38 SHY1YGR112W 1170 nt10.46□□□□□ -0.73
RPS6BP0CX38 YJL067WYJL067W 351 nt10.45□□□□□ -0.74
RPS6BP0CX38 YJL118WYJL118W 660 nt10.45□□□□□ -0.74
RPS6BP0CX38 LIP1YMR298W 453 nt10.45□□□□□ -0.74
RPS6BP0CX38 NDI1YML120C 1542 nt10.44□□□□□ -0.74
RPS6BP0CX38 SED1YDR077W 1017 nt10.44□□□□□ -0.74
RPS6BP0CX38 AKR2YOR034C 2250 nt10.43□□□□□ -0.74
RPS6BP0CX38 INA1YLR413W 2028 nt10.42□□□□□ -0.74
RPS6BP0CX38 YPL251WYPL251W 303 nt10.4□□□□□ -0.74
RPS6BP0CX38 PAB1YER165W 1734 nt10.4□□□□□ -0.74
RPS6BP0CX38 ALP1YNL270C 1722 nt10.4□□□□□ -0.74
RPS6BP0CX38 SPT20YOL148C 1815 nt10.4□□□□□ -0.75
RPS6BP0CX38 FIT3YOR383C 615 nt10.39□□□□□ -0.75
RPS6BP0CX38 SBA1YKL117W 651 nt10.38□□□□□ -0.75
RPS6BP0CX38 LEU9YOR108W 1815 nt10.37□□□□□ -0.75
RPS6BP0CX38 UFO1YML088W 2007 nt10.37□□□□□ -0.75
RPS6BP0CX38 HSL7YBR133C 2484 nt10.35□□□□□ -0.75
RPS6BP0CX38 YLR279WYLR279W 390 nt10.35□□□□□ -0.75
RPS6BP0CX38 BRR1YPR057W 1026 nt10.34□□□□□ -0.75
RPS6BP0CX38 MSB4YOL112W 1479 nt10.32□□□□□ -0.76
RPS6BP0CX38 SAM1YLR180W 1149 nt10.32□□□□□ -0.76
RPS6BP0CX38 TOA2YKL058W 369 nt10.31□□□□□ -0.76
RPS6BP0CX38 TSC10YBR265W 963 nt10.31□□□□□ -0.76
RPS6BP0CX38 URA6YKL024C 615 nt10.3□□□□□ -0.76
RPS6BP0CX38 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt10.29□□□□□ -0.76
RPS6BP0CX38 YGR012WYGR012W 1182 nt10.28□□□□□ -0.76
RPS6BP0CX38 YMR103CYMR103C 363 nt10.28□□□□□ -0.76
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