Protein–RNA interactions for Protein: P0CX22

YRF1-8, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 8, yeastyeast

Predictions only

Length 1,796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-8P0CX22 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt15.13■□□□□ 0.01
YRF1-8P0CX22 LOT5YKL183W 921 nt15.11■□□□□ 0.01
YRF1-8P0CX22 YJR114WYJR114W 393 nt15.11■□□□□ 0.01
YRF1-8P0CX22 NAP1YKR048C 1254 nt15.11■□□□□ 0.01
YRF1-8P0CX22 DUT1YBR252W 444 nt15.09■□□□□ 0.01
YRF1-8P0CX22 YCR102CYCR102C 1107 nt15.07■□□□□ 0
YRF1-8P0CX22 SEC11YIR022W 504 nt15.05■□□□□ -0
YRF1-8P0CX22 YPI1YFR003C 468 nt15.04■□□□□ -0
YRF1-8P0CX22 HIP1YGR191W 1812 nt15.03■□□□□ -0
YRF1-8P0CX22 AGP1YCL025C 1902 nt15.03■□□□□ -0
YRF1-8P0CX22 GOR1YNL274C 1053 nt15.02□□□□□ -0.01
YRF1-8P0CX22 PGC1YPL206C 966 nt14.98□□□□□ -0.01
YRF1-8P0CX22 TIR3YIL011W 810 nt14.97□□□□□ -0.01
YRF1-8P0CX22 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt14.96□□□□□ -0.01
YRF1-8P0CX22 PAU5YFL020C 369 nt14.93□□□□□ -0.02
YRF1-8P0CX22 PCH2YBR186W 1695 nt14.92□□□□□ -0.02
YRF1-8P0CX22 SLG1YOR008C 1137 nt14.92□□□□□ -0.02
YRF1-8P0CX22 APT2YDR441C 546 nt14.9□□□□□ -0.02
YRF1-8P0CX22 YJL064WYJL064W 396 nt14.9□□□□□ -0.02
YRF1-8P0CX22 TIF6YPR016C 738 nt14.88□□□□□ -0.03
YRF1-8P0CX22 BOP3YNL042W 1191 nt14.87□□□□□ -0.03
YRF1-8P0CX22 GND1YHR183W 1470 nt14.86□□□□□ -0.03
YRF1-8P0CX22 RIB2YOL066C 1776 nt14.85□□□□□ -0.03
YRF1-8P0CX22 YBR232CYBR232C 360 nt14.85□□□□□ -0.03
YRF1-8P0CX22 NBP35YGL091C 987 nt14.83□□□□□ -0.03
YRF1-8P0CX22 ZTA1YBR046C 1005 nt14.83□□□□□ -0.03
YRF1-8P0CX22 PAU19YMR325W 375 nt14.83□□□□□ -0.04
YRF1-8P0CX22 POM34YLR018C 900 nt14.81□□□□□ -0.04
YRF1-8P0CX22 RTF1YGL244W 1677 nt14.81□□□□□ -0.04
YRF1-8P0CX22 RAX1YOR301W 1308 nt14.81□□□□□ -0.04
YRF1-8P0CX22 ATG15YCR068W 1563 nt14.79□□□□□ -0.04
YRF1-8P0CX22 TIP1YBR067C 633 nt14.77□□□□□ -0.05
YRF1-8P0CX22 MET28YIR017C 564 nt14.75□□□□□ -0.05
YRF1-8P0CX22 AQY2YLL052C 450 nt14.75□□□□□ -0.05
YRF1-8P0CX22 ALD4YOR374W 1560 nt14.73□□□□□ -0.05
YRF1-8P0CX22 ERG6YML008C 1152 nt14.73□□□□□ -0.05
YRF1-8P0CX22 CCA1YER168C 1641 nt14.73□□□□□ -0.05
YRF1-8P0CX22 GUT2YIL155C 1950 nt14.73□□□□□ -0.05
YRF1-8P0CX22 LSB3YFR024C-A 1380 nt14.73□□□□□ -0.05
YRF1-8P0CX22 PRO1YDR300C 1287 nt14.72□□□□□ -0.05
YRF1-8P0CX22 BDF1YLR399C 2061 nt14.72□□□□□ -0.05
YRF1-8P0CX22 TIM44YIL022W 1296 nt14.7□□□□□ -0.06
YRF1-8P0CX22 PIB2YGL023C 1908 nt14.7□□□□□ -0.06
YRF1-8P0CX22 SMM1YNR015W 1155 nt14.68□□□□□ -0.06
YRF1-8P0CX22 TAT1YBR069C 1860 nt14.68□□□□□ -0.06
YRF1-8P0CX22 YML089CYML089C 369 nt14.64□□□□□ -0.07
YRF1-8P0CX22 AKR2YOR034C 2250 nt14.63□□□□□ -0.07
YRF1-8P0CX22 YJL055WYJL055W 738 nt14.62□□□□□ -0.07
YRF1-8P0CX22 FIT3YOR383C 615 nt14.62□□□□□ -0.07
YRF1-8P0CX22 RDN18-1RDN18-1 1800 nt14.58□□□□□ -0.07
YRF1-8P0CX22 RDN18-2RDN18-2 1800 nt14.58□□□□□ -0.07
YRF1-8P0CX22 YFL054CYFL054C 1941 nt14.56□□□□□ -0.08
YRF1-8P0CX22 PRY1YJL079C 900 nt14.55□□□□□ -0.08
YRF1-8P0CX22 RIB1YBL033C 1038 nt14.53□□□□□ -0.08
YRF1-8P0CX22 PTK1YKL198C 1989 nt14.53□□□□□ -0.08
YRF1-8P0CX22 LSC2YGR244C 1284 nt14.52□□□□□ -0.09
YRF1-8P0CX22 UGA4YDL210W 1716 nt14.52□□□□□ -0.09
YRF1-8P0CX22 STP3YLR375W 1032 nt14.5□□□□□ -0.09
YRF1-8P0CX22 POP2YNR052C 1302 nt14.48□□□□□ -0.09
YRF1-8P0CX22 HXT12YIL170W 1374 nt14.47□□□□□ -0.09
YRF1-8P0CX22 DUS1YML080W 1272 nt14.47□□□□□ -0.09
YRF1-8P0CX22 THI72YOR192C 1800 nt14.46□□□□□ -0.09
YRF1-8P0CX22 FCY21YER060W 1587 nt14.43□□□□□ -0.1
YRF1-8P0CX22 CCT5YJR064W 1689 nt14.42□□□□□ -0.1
YRF1-8P0CX22 VRG4YGL225W 1014 nt14.42□□□□□ -0.1
YRF1-8P0CX22 SOD2YHR008C 702 nt14.42□□□□□ -0.1
YRF1-8P0CX22 DIF1YLR437C 402 nt14.41□□□□□ -0.1
YRF1-8P0CX22 YER152W-AYER152W-A 567 nt14.39□□□□□ -0.11
YRF1-8P0CX22 STR3YGL184C 1398 nt14.39□□□□□ -0.11
YRF1-8P0CX22 QDR2YIL121W 1629 nt14.39□□□□□ -0.11
YRF1-8P0CX22 BMT6YLR063W 1098 nt14.39□□□□□ -0.11
YRF1-8P0CX22 YAR028WYAR028W 705 nt14.37□□□□□ -0.11
YRF1-8P0CX22 GAP1YKR039W 1809 nt14.35□□□□□ -0.11
YRF1-8P0CX22 YIA6YIL006W 1122 nt14.32□□□□□ -0.12
YRF1-8P0CX22 SWE1YJL187C 2460 nt14.32□□□□□ -0.12
YRF1-8P0CX22 HSP60YLR259C 1719 nt14.32□□□□□ -0.12
YRF1-8P0CX22 MTG2YHR168W 1557 nt14.3□□□□□ -0.12
YRF1-8P0CX22 ARP6YLR085C 1317 nt14.29□□□□□ -0.12
YRF1-8P0CX22 ALP1YNL270C 1722 nt14.26□□□□□ -0.13
YRF1-8P0CX22 YJL118WYJL118W 660 nt14.22□□□□□ -0.13
YRF1-8P0CX22 YCL074WYCL074W 927 nt14.21□□□□□ -0.13
YRF1-8P0CX22 YMR262WYMR262W 942 nt14.21□□□□□ -0.13
YRF1-8P0CX22 SNZ1YMR096W 894 nt14.2□□□□□ -0.14
YRF1-8P0CX22 PLB1YMR008C 1995 nt14.19□□□□□ -0.14
YRF1-8P0CX22 TAF13YML098W 504 nt14.17□□□□□ -0.14
YRF1-8P0CX22 APS2YJR058C 444 nt14.16□□□□□ -0.14
YRF1-8P0CX22 PAR32YDL173W 888 nt14.14□□□□□ -0.15
YRF1-8P0CX22 KRE1YNL322C 942 nt14.13□□□□□ -0.15
YRF1-8P0CX22 TUB4YLR212C 1422 nt14.12□□□□□ -0.15
YRF1-8P0CX22 UTR1YJR049C 1593 nt14.12□□□□□ -0.15
YRF1-8P0CX22 GAL3YDR009W 1563 nt14.11□□□□□ -0.15
YRF1-8P0CX22 RTN2YDL204W 1182 nt14.11□□□□□ -0.15
YRF1-8P0CX22 MEP3YPR138C 1470 nt14.1□□□□□ -0.15
YRF1-8P0CX22 BUD20YLR074C 501 nt14.09□□□□□ -0.15
YRF1-8P0CX22 YCP4YCR004C 744 nt14.08□□□□□ -0.16
YRF1-8P0CX22 YER190C-AYER190C-A 576 nt14.06□□□□□ -0.16
YRF1-8P0CX22 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt14.06□□□□□ -0.16
YRF1-8P0CX22 YML133W-AYML133W-A 576 nt14.06□□□□□ -0.16
YRF1-8P0CX22 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt14.06□□□□□ -0.16
YRF1-8P0CX22 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 66.2 ms