Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC6Q9Y210 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC6Q9Y210 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms