Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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KRTAP9-2Q9BYQ4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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KRTAP9-2Q9BYQ4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-2Q9BYQ4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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KRTAP9-2Q9BYQ4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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KRTAP9-2Q9BYQ4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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KRTAP9-2Q9BYQ4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 OSTCP1-202ENST00000522287 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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