Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC30Q5VVM6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms