Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF4Q2M2E3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF4Q2M2E3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms