Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAPC2Q13487 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SNAPC2Q13487 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
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