Protein–RNA interactions for Protein: P55042

RRAD, GTP-binding protein RAD, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRADP55042 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RRADP55042 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RRADP55042 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RRADP55042 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RRADP55042 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RRADP55042 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RRADP55042 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RRADP55042 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RRADP55042 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RRADP55042 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RRADP55042 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RRADP55042 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RRADP55042 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RRADP55042 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RRADP55042 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RRADP55042 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RRADP55042 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RRADP55042 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RRADP55042 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RRADP55042 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RRADP55042 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RRADP55042 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RRADP55042 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RRADP55042 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RRADP55042 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RRADP55042 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RRADP55042 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RRADP55042 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RRADP55042 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RRADP55042 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RRADP55042 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RRADP55042 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RRADP55042 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RRADP55042 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RRADP55042 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RRADP55042 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RRADP55042 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RRADP55042 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RRADP55042 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RRADP55042 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RRADP55042 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RRADP55042 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RRADP55042 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RRADP55042 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RRADP55042 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RRADP55042 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RRADP55042 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RRADP55042 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RRADP55042 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RRADP55042 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RRADP55042 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RRADP55042 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RRADP55042 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RRADP55042 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RRADP55042 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RRADP55042 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RRADP55042 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RRADP55042 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RRADP55042 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RRADP55042 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RRADP55042 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RRADP55042 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RRADP55042 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RRADP55042 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RRADP55042 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RRADP55042 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RRADP55042 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RRADP55042 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRADP55042 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRADP55042 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRADP55042 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRADP55042 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRADP55042 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRADP55042 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRADP55042 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRADP55042 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRADP55042 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRADP55042 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRADP55042 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRADP55042 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRADP55042 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRADP55042 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRADP55042 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRADP55042 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRADP55042 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRADP55042 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RRADP55042 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RRADP55042 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RRADP55042 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RRADP55042 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RRADP55042 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RRADP55042 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RRADP55042 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RRADP55042 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RRADP55042 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RRADP55042 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RRADP55042 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RRADP55042 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RRADP55042 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RRADP55042 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms