Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB1P53618 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB1P53618 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB1P53618 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB1P53618 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB1P53618 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB1P53618 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB1P53618 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB1P53618 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB1P53618 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB1P53618 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB1P53618 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB1P53618 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB1P53618 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB1P53618 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB1P53618 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB1P53618 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB1P53618 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB1P53618 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB1P53618 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB1P53618 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB1P53618 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPB1P53618 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPB1P53618 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPB1P53618 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPB1P53618 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPB1P53618 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COPB1P53618 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPB1P53618 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPB1P53618 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB1P53618 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB1P53618 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB1P53618 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB1P53618 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB1P53618 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB1P53618 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB1P53618 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB1P53618 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPB1P53618 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPB1P53618 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPB1P53618 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPB1P53618 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPB1P53618 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPB1P53618 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPB1P53618 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COPB1P53618 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COPB1P53618 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COPB1P53618 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COPB1P53618 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPB1P53618 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COPB1P53618 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COPB1P53618 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB1P53618 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB1P53618 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB1P53618 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB1P53618 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB1P53618 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB1P53618 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB1P53618 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB1P53618 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB1P53618 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB1P53618 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPB1P53618 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB1P53618 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB1P53618 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB1P53618 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB1P53618 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB1P53618 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB1P53618 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB1P53618 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB1P53618 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB1P53618 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB1P53618 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB1P53618 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB1P53618 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB1P53618 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPB1P53618 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB1P53618 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB1P53618 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB1P53618 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB1P53618 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB1P53618 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB1P53618 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB1P53618 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB1P53618 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB1P53618 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB1P53618 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPB1P53618 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB1P53618 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB1P53618 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB1P53618 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB1P53618 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB1P53618 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB1P53618 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB1P53618 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB1P53618 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB1P53618 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB1P53618 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB1P53618 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPB1P53618 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms