Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TNIKQ9UKE5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
TNIKQ9UKE5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms