Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRIP3Q6Q6R5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms