Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WASHC2DQ5SRD0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms