Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGM1P36871 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PGM1P36871 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGM1P36871 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGM1P36871 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGM1P36871 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGM1P36871 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGM1P36871 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGM1P36871 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGM1P36871 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGM1P36871 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGM1P36871 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGM1P36871 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGM1P36871 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PGM1P36871 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PGM1P36871 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGM1P36871 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGM1P36871 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGM1P36871 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGM1P36871 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGM1P36871 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGM1P36871 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGM1P36871 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGM1P36871 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGM1P36871 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGM1P36871 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGM1P36871 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGM1P36871 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGM1P36871 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGM1P36871 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGM1P36871 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGM1P36871 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PGM1P36871 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGM1P36871 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGM1P36871 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGM1P36871 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PGM1P36871 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGM1P36871 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGM1P36871 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGM1P36871 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGM1P36871 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGM1P36871 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGM1P36871 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGM1P36871 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGM1P36871 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGM1P36871 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGM1P36871 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGM1P36871 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGM1P36871 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGM1P36871 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGM1P36871 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGM1P36871 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGM1P36871 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGM1P36871 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGM1P36871 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGM1P36871 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGM1P36871 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGM1P36871 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGM1P36871 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGM1P36871 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGM1P36871 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGM1P36871 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGM1P36871 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGM1P36871 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGM1P36871 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGM1P36871 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PGM1P36871 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGM1P36871 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGM1P36871 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGM1P36871 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGM1P36871 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PGM1P36871 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PGM1P36871 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PGM1P36871 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGM1P36871 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGM1P36871 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGM1P36871 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGM1P36871 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGM1P36871 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGM1P36871 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGM1P36871 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGM1P36871 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGM1P36871 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGM1P36871 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PGM1P36871 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGM1P36871 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGM1P36871 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGM1P36871 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGM1P36871 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGM1P36871 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGM1P36871 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PGM1P36871 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGM1P36871 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGM1P36871 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGM1P36871 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGM1P36871 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGM1P36871 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGM1P36871 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGM1P36871 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGM1P36871 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms