Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LYVE1Q9Y5Y7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms