Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDP1Q9P0J1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms