Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPNS2Q96L46 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS2Q96L46 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
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