Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC181Q5TID7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms