Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP8A1Q9Y2Q0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms