Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZCCHC17Q9NP64 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZCCHC17Q9NP64 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms