Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGBD1Q96JS3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms