Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms