Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 PLP2YOR281C 861 nt4.61□□□□□ -1.67
VFA1P40080 YPL278CYPL278C 303 nt4.61□□□□□ -1.67
VFA1P40080 PBN1YCL052C 1251 nt4.61□□□□□ -1.67
VFA1P40080 PUF2YPR042C 3228 nt4.61□□□□□ -1.67
VFA1P40080 ALG1YBR110W 1350 nt4.61□□□□□ -1.67
VFA1P40080 PHM7YOL084W 2976 nt4.61□□□□□ -1.67
VFA1P40080 FLO8YER109C 2400 nt4.61□□□□□ -1.67
VFA1P40080 TOG1YER184C 2385 nt4.6□□□□□ -1.67
VFA1P40080 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt4.6□□□□□ -1.67
VFA1P40080 SOL3YHR163W 750 nt4.6□□□□□ -1.67
VFA1P40080 YJL028WYJL028W 336 nt4.6□□□□□ -1.67
VFA1P40080 RIF2YLR453C 1188 nt4.6□□□□□ -1.67
VFA1P40080 SAD1YFR005C 1347 nt4.6□□□□□ -1.67
VFA1P40080 NEM1YHR004C 1341 nt4.6□□□□□ -1.67
VFA1P40080 CEG1YGL130W 1380 nt4.6□□□□□ -1.67
VFA1P40080 TFA1YKL028W 1449 nt4.6□□□□□ -1.67
VFA1P40080 NAM9YNL137C 1461 nt4.6□□□□□ -1.67
VFA1P40080 ARX1YDR101C 1782 nt4.6□□□□□ -1.67
VFA1P40080 ARN1YHL040C 1884 nt4.6□□□□□ -1.67
VFA1P40080 GSY1YFR015C 2127 nt4.6□□□□□ -1.67
VFA1P40080 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt4.59□□□□□ -1.67
VFA1P40080 SHU2YDR078C 672 nt4.59□□□□□ -1.67
VFA1P40080 ISC10YER180C 804 nt4.59□□□□□ -1.67
VFA1P40080 YIL171WYIL171W 330 nt4.59□□□□□ -1.67
VFA1P40080 FMP46YKR049C 402 nt4.59□□□□□ -1.67
VFA1P40080 SMD3YLR147C 306 nt4.59□□□□□ -1.67
VFA1P40080 GPI12YMR281W 915 nt4.59□□□□□ -1.67
VFA1P40080 SUI1YNL244C 327 nt4.59□□□□□ -1.67
VFA1P40080 YNL303WYNL303W 348 nt4.59□□□□□ -1.67
VFA1P40080 GCR1YPL075W 2358 nt4.59□□□□□ -1.67
VFA1P40080 SAF1YBR280C 1914 nt4.59□□□□□ -1.67
VFA1P40080 RER1YCL001W 567 nt4.59□□□□□ -1.67
VFA1P40080 DPH6YLR143W 2058 nt4.58□□□□□ -1.68
VFA1P40080 LAS1YKR063C 1509 nt4.58□□□□□ -1.68
VFA1P40080 YMR111CYMR111C 1389 nt4.58□□□□□ -1.68
VFA1P40080 EMP47YFL048C 1338 nt4.58□□□□□ -1.68
VFA1P40080 COQ4YDR204W 1008 nt4.58□□□□□ -1.68
VFA1P40080 GRX4YER174C 735 nt4.58□□□□□ -1.68
VFA1P40080 HTD2YHR067W 843 nt4.58□□□□□ -1.68
VFA1P40080 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.58□□□□□ -1.68
VFA1P40080 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.58□□□□□ -1.68
VFA1P40080 RPP0YLR340W 939 nt4.58□□□□□ -1.68
VFA1P40080 ARO4YBR249C 1113 nt4.58□□□□□ -1.68
VFA1P40080 PMC1YGL006W 3522 nt4.58□□□□□ -1.68
VFA1P40080 RPN4YDL020C 1596 nt4.57□□□□□ -1.68
VFA1P40080 VHS2YIL135C 1311 nt4.57□□□□□ -1.68
VFA1P40080 TRF5YNL299W 1929 nt4.57□□□□□ -1.68
VFA1P40080 RPL24AYGL031C 468 nt4.57□□□□□ -1.68
VFA1P40080 SOL4YGR248W 768 nt4.57□□□□□ -1.68
VFA1P40080 ACP1YKL192C 378 nt4.57□□□□□ -1.68
VFA1P40080 GPN3YLR243W 819 nt4.57□□□□□ -1.68
VFA1P40080 ATG8YBL078C 354 nt4.57□□□□□ -1.68
VFA1P40080 UFE1YOR075W 1041 nt4.57□□□□□ -1.68
VFA1P40080 IPP1YBR011C 864 nt4.57□□□□□ -1.68
VFA1P40080 SFG1YOR315W 1041 nt4.57□□□□□ -1.68
VFA1P40080 POC4YPL144W 447 nt4.57□□□□□ -1.68
VFA1P40080 YPR071WYPR071W 636 nt4.57□□□□□ -1.68
VFA1P40080 ICS2YBR157C 768 nt4.57□□□□□ -1.68
VFA1P40080 RRP7YCL031C 894 nt4.57□□□□□ -1.68
VFA1P40080 HPC2YBR215W 1878 nt4.57□□□□□ -1.68
VFA1P40080 KCC4YCL024W 3114 nt4.57□□□□□ -1.68
VFA1P40080 TYW1YPL207W 2433 nt4.57□□□□□ -1.68
VFA1P40080 PMT4YJR143C 2289 nt4.57□□□□□ -1.68
VFA1P40080 HRK1YOR267C 2280 nt4.57□□□□□ -1.68
VFA1P40080 YKR015CYKR015C 1707 nt4.56□□□□□ -1.68
VFA1P40080 ARC15YIL062C 465 nt4.56□□□□□ -1.68
VFA1P40080 CYC1YJR048W 330 nt4.56□□□□□ -1.68
VFA1P40080 BOS1YLR078C 735 nt4.56□□□□□ -1.68
VFA1P40080 RPB8YOR224C 441 nt4.56□□□□□ -1.68
VFA1P40080 YOR338WYOR338W 1092 nt4.56□□□□□ -1.68
VFA1P40080 GZF3YJL110C 1656 nt4.56□□□□□ -1.68
VFA1P40080 TRE2YOR256C 2430 nt4.55□□□□□ -1.68
VFA1P40080 CBS2YDR197W 1170 nt4.55□□□□□ -1.68
VFA1P40080 YGL185CYGL185C 1140 nt4.55□□□□□ -1.68
VFA1P40080 ECT1YGR007W 972 nt4.55□□□□□ -1.68
VFA1P40080 PCL7YIL050W 858 nt4.55□□□□□ -1.68
VFA1P40080 GAT3YLR013W 426 nt4.55□□□□□ -1.68
VFA1P40080 SPC2YML055W 537 nt4.55□□□□□ -1.68
VFA1P40080 OSW1YOR255W 837 nt4.55□□□□□ -1.68
VFA1P40080 YOR379CYOR379C 339 nt4.55□□□□□ -1.68
VFA1P40080 PRM4YPL156C 855 nt4.55□□□□□ -1.68
VFA1P40080 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt4.55□□□□□ -1.68
VFA1P40080 CTK1YKL139W 1587 nt4.55□□□□□ -1.68
VFA1P40080 SPO1YNL012W 1896 nt4.55□□□□□ -1.68
VFA1P40080 IMA1YGR287C 1770 nt4.55□□□□□ -1.68
VFA1P40080 GAS4YOL132W 1416 nt4.55□□□□□ -1.68
VFA1P40080 GAT2YMR136W 1683 nt4.54□□□□□ -1.68
VFA1P40080 THI20YOL055C 1656 nt4.54□□□□□ -1.68
VFA1P40080 YFL040WYFL040W 1623 nt4.54□□□□□ -1.68
VFA1P40080 TRM11YOL124C 1302 nt4.54□□□□□ -1.68
VFA1P40080 KTR6YPL053C 1341 nt4.54□□□□□ -1.68
VFA1P40080 TRE1YPL176C 2352 nt4.54□□□□□ -1.68
VFA1P40080 YHR054CYHR054C 1065 nt4.54□□□□□ -1.68
VFA1P40080 YJR096WYJR096W 849 nt4.54□□□□□ -1.68
VFA1P40080 ISA1YLL027W 753 nt4.54□□□□□ -1.68
VFA1P40080 YLR156WYLR156W 345 nt4.54□□□□□ -1.68
VFA1P40080 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt4.54□□□□□ -1.68
VFA1P40080 YLR159WYLR159W 345 nt4.54□□□□□ -1.68
VFA1P40080 YLR161WYLR161W 345 nt4.54□□□□□ -1.68
VFA1P40080 RCE1YMR274C 948 nt4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.7 ms