Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL356019.1-201ENST00000553419 748 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 CLCN5-205ENST00000482218 449 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-2Q9BYQ4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms