Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MIPEPQ99797 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MIPEPQ99797 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms