Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIGQ13278 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIGQ13278 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIGQ13278 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIGQ13278 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIGQ13278 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RIGQ13278 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIGQ13278 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIGQ13278 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIGQ13278 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIGQ13278 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIGQ13278 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIGQ13278 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIGQ13278 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIGQ13278 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIGQ13278 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIGQ13278 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RIGQ13278 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RIGQ13278 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIGQ13278 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIGQ13278 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIGQ13278 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIGQ13278 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIGQ13278 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIGQ13278 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIGQ13278 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIGQ13278 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIGQ13278 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIGQ13278 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIGQ13278 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIGQ13278 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIGQ13278 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RIGQ13278 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RIGQ13278 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIGQ13278 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIGQ13278 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIGQ13278 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIGQ13278 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIGQ13278 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIGQ13278 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIGQ13278 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIGQ13278 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIGQ13278 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIGQ13278 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RIGQ13278 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RIGQ13278 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIGQ13278 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIGQ13278 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIGQ13278 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIGQ13278 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIGQ13278 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIGQ13278 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIGQ13278 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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