Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 ARC40YBR234C 1155 nt4.38□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 MRPL37YBR268W 318 nt4.38□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 STB2YMR053C 2553 nt4.38□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 FBP26YJL155C 1359 nt4.38□□□□□ -1.71 RIP-Chip
PUF2Q12221 LAP3YNL239W 1365 nt4.38□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 SUL2YLR092W 2682 nt4.38□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 MDL1YLR188W 2088 nt4.37□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 IMA3YIL172C 1770 nt4.37□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 IMA4YJL221C 1770 nt4.37□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 PBI1YPL272C 1554 nt4.37□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 SKM1YOL113W 1968 nt4.37□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 PER1YCR044C 1074 nt4.37□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 API2YDR525W 330 nt4.37□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 NPY1YGL067W 1155 nt4.37□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 TVP38YKR088C 1014 nt4.37□□□□□ -1.71 RIP-Chip
PUF2Q12221 SIC1YLR079W 855 nt4.37□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 OPY2YPR075C 1083 nt4.37□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 CSH1YBR161W 1131 nt4.37□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 CTT1YGR088W 1689 nt4.37□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 ECM18YDR125C 1362 nt4.37□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 TDA11YHR159W 1515 nt4.36□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 NNK1YKL171W 2787 nt4.36□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 RPL34AYER056C-A 366 nt4.36□□□□□ -1.71 RIP-Chip
PUF2Q12221 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.36□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.36□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.36□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.36□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.36□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.36□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.36□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.36□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.36□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.36□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.36□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.36□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.36□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.36□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 RPS10BYMR230W 318 nt4.36□□□□□ -1.71 RIP-Chip
PUF2Q12221 CDC21YOR074C 915 nt4.36□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 TAF3YPL011C 1062 nt4.36□□□□□ -1.71 RIP-Chip
PUF2Q12221 ARL3YPL051W 597 nt4.36□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 TFC7YOR110W 1308 nt4.36□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 HOT1YMR172W 2160 nt4.36□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 PMT4YJR143C 2289 nt4.35□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 YKR015CYKR015C 1707 nt4.35□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 TPO2YGR138C 1845 nt4.35□□□□□ -1.71 RIP-Chip
PUF2Q12221 snR7-SsnR7-S 179 nt4.35□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt4.35□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 GPP1YIL053W 753 nt4.35□□□□□ -1.71 RIP-Chip
PUF2Q12221 YLR407WYLR407W 687 nt4.35□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 YIM1YMR152W 1098 nt4.35□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 RUF20RUF20 443 nt4.35□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 YBL062WYBL062W 381 nt4.35□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 COG5YNL051W 1212 nt4.35□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 MED7YOL135C 669 nt4.35□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 IPP1YBR011C 864 nt4.35□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 RAD52YML032C 1416 nt4.35□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 HFA1YMR207C 6372 nt4.35□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 YPS7YDR349C 1791 nt4.35□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 KIN28YDL108W 921 nt4.34□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 TMA17YDL110C 453 nt4.34□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 UBC8YEL012W 657 nt4.34□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 BMH1YER177W 804 nt4.34□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 ARC1YGL105W 1131 nt4.34□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 YIL163CYIL163C 354 nt4.34□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 DAL2YIR029W 1032 nt4.34□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 CTK2YJL006C 972 nt4.34□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 URA5YML106W 681 nt4.34□□□□□ -1.71 RIP-Chip
PUF2Q12221 CMR3YPR013C 954 nt4.34□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 YBR219CYBR219C 384 nt4.34□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 PBP2YBR233W 1242 nt4.34□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 TYR1YBR166C 1359 nt4.34□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 TRM13YOL125W 1431 nt4.34□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 DIT2YDR402C 1470 nt4.34□□□□□ -1.71
PUF2Q12221 TYW1YPL207W 2433 nt4.33□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 NUP2YLR335W 2163 nt4.33□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 MET4YNL103W 2019 nt4.33□□□□□ -1.72 RIP-Chip
PUF2Q12221 SLS1YLR139C 1932 nt4.33□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 MAK11YKL021C 1407 nt4.33□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 SAD1YFR005C 1347 nt4.33□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 BUD25YER014C-A 462 nt4.33□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt4.33□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt4.33□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt4.33□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 PEX14YGL153W 1026 nt4.33□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 BUD13YGL174W 801 nt4.33□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 CUP1-1YHR053C 186 nt4.33□□□□□ -1.72 RIP-Chip
PUF2Q12221 CUP1-2YHR055C 186 nt4.33□□□□□ -1.72 RIP-Chip
PUF2Q12221 EST3YIL009C-A 546 nt4.33□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 HOT13YKL084W 351 nt4.33□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YML031C-AYML031C-A 336 nt4.33□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 CPR3YML078W 549 nt4.33□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 VPS20YMR077C 666 nt4.33□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YNL181WYNL181W 1224 nt4.33□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YOL118CYOL118C 309 nt4.33□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 TGL4YKR089C 2733 nt4.33□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 IKS1YJL057C 2004 nt4.33□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 STR2YJR130C 1920 nt4.33□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 TRM11YOL124C 1302 nt4.32□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 CBS2YDR197W 1170 nt4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.2 ms