Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NEFLP07196 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NEFLP07196 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEFLP07196 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEFLP07196 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEFLP07196 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEFLP07196 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEFLP07196 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEFLP07196 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEFLP07196 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEFLP07196 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEFLP07196 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEFLP07196 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NEFLP07196 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NEFLP07196 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NEFLP07196 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEFLP07196 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEFLP07196 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NEFLP07196 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NEFLP07196 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NEFLP07196 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NEFLP07196 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEFLP07196 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEFLP07196 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEFLP07196 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEFLP07196 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEFLP07196 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NEFLP07196 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEFLP07196 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEFLP07196 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEFLP07196 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEFLP07196 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEFLP07196 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEFLP07196 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEFLP07196 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEFLP07196 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEFLP07196 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEFLP07196 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEFLP07196 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEFLP07196 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEFLP07196 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEFLP07196 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEFLP07196 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEFLP07196 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEFLP07196 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEFLP07196 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEFLP07196 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEFLP07196 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEFLP07196 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEFLP07196 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEFLP07196 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEFLP07196 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEFLP07196 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEFLP07196 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEFLP07196 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEFLP07196 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEFLP07196 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEFLP07196 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEFLP07196 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEFLP07196 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEFLP07196 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEFLP07196 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEFLP07196 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEFLP07196 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEFLP07196 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEFLP07196 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEFLP07196 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEFLP07196 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEFLP07196 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEFLP07196 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEFLP07196 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEFLP07196 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEFLP07196 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEFLP07196 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEFLP07196 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEFLP07196 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEFLP07196 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEFLP07196 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEFLP07196 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEFLP07196 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEFLP07196 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEFLP07196 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEFLP07196 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEFLP07196 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEFLP07196 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEFLP07196 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEFLP07196 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFLP07196 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFLP07196 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFLP07196 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFLP07196 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFLP07196 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFLP07196 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFLP07196 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFLP07196 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFLP07196 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFLP07196 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEFLP07196 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEFLP07196 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEFLP07196 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms