Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SETD1BQ9UPS6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SETD1BQ9UPS6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms