Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SARS2Q9NP81 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SARS2Q9NP81 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms