Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPRD1AQ96P16 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms