Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18Q15532 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18Q15532 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18Q15532 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18Q15532 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18Q15532 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18Q15532 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18Q15532 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18Q15532 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SS18Q15532 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18Q15532 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18Q15532 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18Q15532 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18Q15532 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18Q15532 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18Q15532 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18Q15532 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18Q15532 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18Q15532 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18Q15532 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18Q15532 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18Q15532 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18Q15532 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18Q15532 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18Q15532 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18Q15532 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18Q15532 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SS18Q15532 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18Q15532 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18Q15532 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18Q15532 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18Q15532 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18Q15532 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18Q15532 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18Q15532 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18Q15532 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18Q15532 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18Q15532 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18Q15532 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18Q15532 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18Q15532 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18Q15532 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18Q15532 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18Q15532 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18Q15532 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SS18Q15532 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18Q15532 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18Q15532 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18Q15532 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18Q15532 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18Q15532 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18Q15532 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18Q15532 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18Q15532 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18Q15532 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18Q15532 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18Q15532 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18Q15532 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18Q15532 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18Q15532 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18Q15532 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SS18Q15532 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18Q15532 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18Q15532 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18Q15532 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18Q15532 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18Q15532 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18Q15532 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18Q15532 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18Q15532 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18Q15532 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18Q15532 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18Q15532 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18Q15532 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18Q15532 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18Q15532 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18Q15532 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18Q15532 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18Q15532 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18Q15532 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18Q15532 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18Q15532 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SS18Q15532 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18Q15532 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18Q15532 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18Q15532 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18Q15532 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18Q15532 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18Q15532 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18Q15532 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18Q15532 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18Q15532 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18Q15532 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18Q15532 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18Q15532 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18Q15532 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18Q15532 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18Q15532 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18Q15532 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18Q15532 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms