Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.087e-7■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.087e-7■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.227e-7■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 GON4L-209ENST00000471341 5097 ntTSL 26.98□□□□□ -1.297e-7■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.327e-7■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 ZNF646-203ENST00000428260 1077 ntTSL 319.61■□□□□ 0.734e-25■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 ZNF646-204ENST00000564189 582 ntTSL 216.31■□□□□ 0.24e-25■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.464e-25■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.654e-8■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.074e-8■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.154e-8■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 ZNF708-202ENST00000598046 2630 ntTSL 1 (best)12.3□□□□□ -0.444e-8■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 ZNF708-204ENST00000602023 590 ntTSL 311.43□□□□□ -0.584e-8■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 ZNF708-201ENST00000356929 4004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.134e-8■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 ZNF708-203ENST00000601295 567 ntTSL 27.73□□□□□ -1.174e-8■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.222e-12■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.42e-12■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.222e-12■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 ASPH-203ENST00000379454 5268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.515e-7■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 PQLC1-204ENST00000466449 2887 ntTSL 216.77■□□□□ 0.288e-7■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 PQLC1-205ENST00000469369 593 ntTSL 412.49□□□□□ -0.418e-7■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 PQLC1-209ENST00000589000 558 ntTSL 410.55□□□□□ -0.728e-7■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.013e-7■■■■■ 42.8
PCBP2Q15366 MCPH1-201ENST00000344683 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.144e-12■■■■■ 42.7
PCBP2Q15366 FARP2-219ENST00000486736 578 ntTSL 312.69□□□□□ -0.381e-17■■■■■ 42.7
PCBP2Q15366 FARP2-220ENST00000491425 484 ntTSL 311.31□□□□□ -0.61e-17■■■■■ 42.7
PCBP2Q15366 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.372e-15■■■■■ 42.7
PCBP2Q15366 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.912e-15■■■■■ 42.7
PCBP2Q15366 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.462e-8■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.191e-40■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 FLOT2-203ENST00000465427 746 ntTSL 511.19□□□□□ -0.623e-18■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 FLOT2-205ENST00000580313 429 ntTSL 37.97□□□□□ -1.133e-18■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 CUX1-218ENST00000560541 3176 ntTSL 511.04□□□□□ -0.648e-7■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 SND1-216ENST00000492840 472 ntTSL 56.59□□□□□ -1.359e-61■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 UCKL1-207ENST00000632800 1530 ntTSL 514.45□□□□□ -0.12e-12■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.331e-18■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.251e-18■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.21e-18■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.898e-7■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.748e-7■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.678e-7■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 PQLC1-206ENST00000474967 2319 ntTSL 519.62■□□□□ 0.738e-7■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 PQLC1-201ENST00000351365 2414 ntTSL 218.14■□□□□ 0.498e-7■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.443e-6■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.496e-7■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 BTBD11-203ENST00000415943 723 ntTSL 517.94■□□□□ 0.466e-7■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 BTBD11-207ENST00000550706 667 ntTSL 517.15■□□□□ 0.346e-7■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.186e-7■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.056e-7■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 RHPN2-204ENST00000588388 2378 ntTSL 212.63□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 RHPN2-201ENST00000254260 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 42.6
PCBP2Q15366 IWS1-204ENST00000436740 608 ntTSL 320.93■□□□□ 0.945e-11■■■■■ 42.5
PCBP2Q15366 IWS1-209ENST00000486662 870 ntTSL 1 (best)20.54■□□□□ 0.885e-11■■■■■ 42.5
PCBP2Q15366 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.35e-11■■■■■ 42.5
PCBP2Q15366 IWS1-202ENST00000409725 1080 ntTSL 213.05□□□□□ -0.325e-11■■■■■ 42.5
PCBP2Q15366 IWS1-208ENST00000483889 588 ntTSL 310.8□□□□□ -0.685e-11■■■■■ 42.5
PCBP2Q15366 IWS1-205ENST00000460511 598 ntTSL 410.67□□□□□ -0.75e-11■■■■■ 42.5
PCBP2Q15366 IWS1-207ENST00000479083 582 ntTSL 29.07□□□□□ -0.965e-11■■■■■ 42.5
PCBP2Q15366 IWS1-210ENST00000495369 811 ntTSL 24.19□□□□□ -1.745e-11■■■■■ 42.5
PCBP2Q15366 RETREG2-201ENST00000273048 2533 ntTSL 1 (best)23.29■■□□□ 1.322e-21■■■■■ 42.5
PCBP2Q15366 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.286e-9■■■■■ 42.5
PCBP2Q15366 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 16e-9■■■■■ 42.5
PCBP2Q15366 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.366e-9■■■■■ 42.5
PCBP2Q15366 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.216e-9■■■■■ 42.5
PCBP2Q15366 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.236e-9■■■■■ 42.5
PCBP2Q15366 DAZAP1-207ENST00000589484 3414 ntTSL 212.08□□□□□ -0.482e-7■■■■■ 42.4
PCBP2Q15366 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.791e-10■■■■■ 42.4
PCBP2Q15366 ADAP1-203ENST00000437486 622 ntTSL 518.98■□□□□ 0.631e-10■■■■■ 42.4
PCBP2Q15366 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.561e-10■■■■■ 42.4
PCBP2Q15366 ADAP1-204ENST00000446141 2085 ntTSL 218.53■□□□□ 0.561e-10■■■■■ 42.4
PCBP2Q15366 ADAP1-213ENST00000488527 584 ntTSL 514.54□□□□□ -0.081e-10■■■■■ 42.4
PCBP2Q15366 ADAP1-207ENST00000453823 560 ntTSL 411.87□□□□□ -0.511e-10■■■■■ 42.4
PCBP2Q15366 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.233e-12■■■■■ 42.4
PCBP2Q15366 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.264e-8■■■■■ 42.4
PCBP2Q15366 PDXDC2P-NPIPB14P-204ENST00000530079 2764 ntTSL 513.07□□□□□ -0.323e-12■■■■■ 42.4
PCBP2Q15366 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.334e-8■■■■■ 42.4
PCBP2Q15366 SLC12A5-204ENST00000428198 248 ntTSL 312.86□□□□□ -0.354e-8■■■■■ 42.4
PCBP2Q15366 PDXDC2P-NPIPB14P-205ENST00000531894 4184 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.563e-12■■■■■ 42.4
PCBP2Q15366 SLC12A5-205ENST00000454036 3593 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.874e-8■■■■■ 42.4
PCBP2Q15366 PRRT2-213ENST00000636902 100 ntTSL 56.56□□□□□ -1.363e-12■■■■■ 42.4
PCBP2Q15366 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.05□□□□□ -1.443e-12■■■■■ 42.4
PCBP2Q15366 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.824e-12■■■■■ 42.4
PCBP2Q15366 SLC12A5-203ENST00000413737 411 ntTSL 33.09□□□□□ -1.914e-8■■■■■ 42.4
PCBP2Q15366 ITGA2-202ENST00000503810 3782 ntTSL 58.78□□□□□ -12e-6■■■■■ 42.4
PCBP2Q15366 MRPL1-201ENST00000315567 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.033e-16■■■■■ 42.4
PCBP2Q15366 MRPL1-202ENST00000502384 898 ntTSL 57.49□□□□□ -1.213e-16■■■■■ 42.4
PCBP2Q15366 MRPL1-204ENST00000506674 832 ntTSL 57.15□□□□□ -1.263e-16■■■■■ 42.4
PCBP2Q15366 L3MBTL1-205ENST00000422861 4322 ntAPPRIS ALT2 TSL 29.13□□□□□ -0.951e-6■■■■■ 42.3
PCBP2Q15366 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 42.3
PCBP2Q15366 GTPBP3-208ENST00000595194 564 ntTSL 219.11■□□□□ 0.655e-16■■■■■ 42.2
PCBP2Q15366 B4GALT6-202ENST00000306851 3891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.958e-8■■■■■ 42.2
PCBP2Q15366 B4GALT6-205ENST00000579372 339 ntTSL 53.96□□□□□ -1.788e-8■■■■■ 42.2
PCBP2Q15366 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.393e-10■■■■■ 42.2
PCBP2Q15366 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.393e-10■■■■■ 42.2
PCBP2Q15366 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.063e-10■■■■■ 42.2
PCBP2Q15366 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.013e-10■■■■■ 42.2
PCBP2Q15366 SUPT20H-222ENST00000495071 3669 ntTSL 513.17□□□□□ -0.33e-10■■■■■ 42.2
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 568.3 ms