Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP1P59025 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTP1P59025 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP1P59025 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP1P59025 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP1P59025 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP1P59025 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP1P59025 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP1P59025 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP1P59025 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP1P59025 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP1P59025 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP1P59025 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTP1P59025 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTP1P59025 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTP1P59025 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTP1P59025 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTP1P59025 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTP1P59025 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTP1P59025 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTP1P59025 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTP1P59025 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTP1P59025 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RTP1P59025 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTP1P59025 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTP1P59025 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTP1P59025 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTP1P59025 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTP1P59025 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTP1P59025 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTP1P59025 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTP1P59025 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTP1P59025 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RTP1P59025 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTP1P59025 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTP1P59025 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTP1P59025 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTP1P59025 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP1P59025 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP1P59025 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP1P59025 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP1P59025 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP1P59025 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP1P59025 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP1P59025 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP1P59025 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP1P59025 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP1P59025 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTP1P59025 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTP1P59025 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTP1P59025 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTP1P59025 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTP1P59025 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTP1P59025 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTP1P59025 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTP1P59025 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP1P59025 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP1P59025 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP1P59025 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP1P59025 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP1P59025 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP1P59025 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP1P59025 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP1P59025 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP1P59025 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP1P59025 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP1P59025 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP1P59025 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP1P59025 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP1P59025 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTP1P59025 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTP1P59025 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RTP1P59025 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTP1P59025 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTP1P59025 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTP1P59025 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTP1P59025 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTP1P59025 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RTP1P59025 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTP1P59025 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTP1P59025 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTP1P59025 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP1P59025 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP1P59025 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP1P59025 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP1P59025 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP1P59025 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP1P59025 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP1P59025 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTP1P59025 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP1P59025 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP1P59025 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP1P59025 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP1P59025 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP1P59025 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP1P59025 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP1P59025 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTP1P59025 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP1P59025 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTP1P59025 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms