Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYL1P12980 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYL1P12980 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYL1P12980 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYL1P12980 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYL1P12980 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYL1P12980 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYL1P12980 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYL1P12980 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYL1P12980 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYL1P12980 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYL1P12980 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYL1P12980 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYL1P12980 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYL1P12980 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYL1P12980 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYL1P12980 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYL1P12980 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYL1P12980 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYL1P12980 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYL1P12980 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYL1P12980 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LYL1P12980 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LYL1P12980 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYL1P12980 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYL1P12980 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYL1P12980 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYL1P12980 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYL1P12980 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYL1P12980 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYL1P12980 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYL1P12980 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYL1P12980 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LYL1P12980 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYL1P12980 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYL1P12980 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYL1P12980 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYL1P12980 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYL1P12980 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYL1P12980 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYL1P12980 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LYL1P12980 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYL1P12980 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYL1P12980 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYL1P12980 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYL1P12980 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYL1P12980 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYL1P12980 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYL1P12980 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYL1P12980 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYL1P12980 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LYL1P12980 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LYL1P12980 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYL1P12980 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYL1P12980 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYL1P12980 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYL1P12980 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYL1P12980 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYL1P12980 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYL1P12980 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LYL1P12980 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYL1P12980 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYL1P12980 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYL1P12980 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYL1P12980 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYL1P12980 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYL1P12980 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYL1P12980 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYL1P12980 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYL1P12980 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYL1P12980 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYL1P12980 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYL1P12980 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYL1P12980 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LYL1P12980 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYL1P12980 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYL1P12980 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYL1P12980 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYL1P12980 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYL1P12980 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LYL1P12980 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LYL1P12980 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYL1P12980 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYL1P12980 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYL1P12980 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYL1P12980 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYL1P12980 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYL1P12980 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYL1P12980 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYL1P12980 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYL1P12980 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYL1P12980 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYL1P12980 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYL1P12980 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYL1P12980 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYL1P12980 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYL1P12980 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYL1P12980 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYL1P12980 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYL1P12980 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms