Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	GAC1	YOR178C	2382 nt		3.05	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	APN2	YBL019W	1563 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	SQS1	YNL224C	2304 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	BCH2	YKR027W	2298 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	APE2	YKL157W	2859 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	YOR022C	YOR022C	2148 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	NCR1	YPL006W	3513 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	RAD26	YJR035W	3258 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	PAD1	YDR538W	729 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	MMM1	YLL006W	1281 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	TVP18	YMR071C	504 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	FLC1	YPL221W	2382 nt		3.04	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	MEK1	YOR351C	1494 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	AZR1	YGR224W	1842 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	MRP13	YGR084C	1020 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	BNS1	YGR230W	414 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	YHL026C	YHL026C	948 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	LNP1	YHR192W	837 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	PER33	YLR064W	822 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	ATG17	YLR423C	1254 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	YML053C	YML053C	639 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	PEP4	YPL154C	1218 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	YPL162C	YPL162C	822 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	PRP22	YER013W	3438 nt		3.03	□□□□□ -1.92
VAR1	P02381	VPS36	YLR417W	1701 nt		3.02	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YDR246W-A	YDR246W-A	201 nt		3.02	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	MAD2	YJL030W	591 nt		3.02	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	PIR3	YKL163W	978 nt		3.02	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	GAT3	YLR013W	426 nt		3.02	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YBR196C-B	YBR196C-B	105 nt		3.02	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	RSF2	YJR127C	4143 nt		3.01	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YLR352W	YLR352W	2424 nt		3.01	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YER134C	YER134C	537 nt		3.01	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YGL199C	YGL199C	471 nt		3.01	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YJR037W	YJR037W	384 nt		3.01	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YJR038C	YJR038C	363 nt		3.01	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	ASC1	YMR116C	960 nt		3.01	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	NRK1	YNL129W	723 nt		3.01	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YGK3	YOL128C	1128 nt		3.01	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	INA17	YPL099C	549 nt		3.01	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YMR018W	YMR018W	1545 nt		3.01	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	ETP1	YHL010C	1758 nt		3.01	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	IML2	YJL082W	2196 nt		3.01	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YKL050C	YKL050C	2769 nt		3	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	ENT1	YDL161W	1365 nt		3	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YDR230W	YDR230W	348 nt		3	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	CAF16	YFL028C	870 nt		3	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YLL017W	YLL017W	312 nt		3	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YOR131C	YOR131C	657 nt		3	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	OAZ1	YPL052W	879 nt		3	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	SLX1	YBR228W	915 nt		3	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	GAS5	YOL030W	1455 nt		3	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	ARO80	YDR421W	2853 nt		3	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	BOI2	YER114C	3123 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YBR225W	YBR225W	2703 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	ALA1	YOR335C	2877 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	GCN5	YGR252W	1320 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YAK1	YJL141C	2424 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	IBA57	YJR122W	1494 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YER076C	YER076C	909 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YGL108C	YGL108C	423 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	RPL15B	YMR121C	615 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YNR061C	YNR061C	660 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	ATG32	YIL146C	1590 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	KIN2	YLR096W	3444 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	SPA2	YLL021W	4401 nt		2.99	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	ROK1	YGL171W	1695 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	ERG5	YMR015C	1617 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	SEC2	YNL272C	2280 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	BAR1	YIL015W	1764 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	CWH43	YCR017C	2862 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	VAC17	YCL063W	1272 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	BMH1	YER177W	804 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YFL065C	YFL065C	309 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YFR034W-A	YFR034W-A	288 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	RPS4B	YHR203C	786 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	RPS4A	YJR145C	786 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	OMS1	YDR316W	1416 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	FRT2	YAL028W	1587 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YMR111C	YMR111C	1389 nt		2.98	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	DEG1	YFL001W	1329 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	VID27	YNL212W	2349 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	ORC4	YPR162C	1590 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	MAL13	YGR288W	1422 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	HSP30	YCR021C	999 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	QRI7	YDL104C	1224 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YER039C-A	YER039C-A	219 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	MIC26	YGR235C	702 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YLR154W-B	YLR154W-B	165 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	MRPL3	YMR024W	1173 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YBL036C	YBL036C	774 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	YNL057W	YNL057W	333 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	PFK26	YIL107C	2484 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	SEC6	YIL068C	2418 nt		2.97	□□□□□ -1.93
VAR1	P02381	ECM16	YMR128W	3804 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	YFT2	YDR319C	825 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	PFA5	YDR459C	1125 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	YER034W	YER034W	558 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	ECO1	YFR027W	846 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	REC104	YHR157W	549 nt		2.96	□□□□□ -1.94

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