Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD9AQ99638 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms