Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDXQ7Z353 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms