Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNCBQ16143 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNCBQ16143 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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