Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIA3P42263 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA3P42263 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms