Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYL1P12980 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYL1P12980 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYL1P12980 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYL1P12980 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYL1P12980 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYL1P12980 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYL1P12980 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYL1P12980 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYL1P12980 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LYL1P12980 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYL1P12980 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYL1P12980 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYL1P12980 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYL1P12980 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYL1P12980 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYL1P12980 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYL1P12980 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYL1P12980 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYL1P12980 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYL1P12980 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYL1P12980 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYL1P12980 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYL1P12980 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYL1P12980 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYL1P12980 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYL1P12980 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYL1P12980 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYL1P12980 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYL1P12980 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYL1P12980 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYL1P12980 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYL1P12980 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYL1P12980 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYL1P12980 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYL1P12980 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYL1P12980 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYL1P12980 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYL1P12980 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYL1P12980 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYL1P12980 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYL1P12980 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYL1P12980 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYL1P12980 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LYL1P12980 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYL1P12980 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYL1P12980 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYL1P12980 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYL1P12980 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYL1P12980 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYL1P12980 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYL1P12980 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYL1P12980 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYL1P12980 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYL1P12980 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYL1P12980 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYL1P12980 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYL1P12980 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYL1P12980 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYL1P12980 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYL1P12980 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYL1P12980 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYL1P12980 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYL1P12980 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYL1P12980 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYL1P12980 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYL1P12980 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYL1P12980 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYL1P12980 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LYL1P12980 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LYL1P12980 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYL1P12980 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYL1P12980 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYL1P12980 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYL1P12980 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYL1P12980 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYL1P12980 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYL1P12980 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYL1P12980 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYL1P12980 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYL1P12980 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYL1P12980 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYL1P12980 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYL1P12980 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYL1P12980 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYL1P12980 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYL1P12980 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYL1P12980 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYL1P12980 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYL1P12980 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYL1P12980 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYL1P12980 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYL1P12980 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYL1P12980 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYL1P12980 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYL1P12980 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYL1P12980 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYL1P12980 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYL1P12980 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYL1P12980 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms