Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIN3BO75182 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIN3BO75182 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms