Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms