Protein–RNA interactions for Protein: H7C0S8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0S8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C0S8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C0S8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C0S8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C0S8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C0S8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C0S8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C0S8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C0S8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0S8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0S8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0S8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0S8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0S8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0S8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0S8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0S8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0S8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0S8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0S8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0S8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0S8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H7C0S8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0S8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0S8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0S8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0S8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0S8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0S8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0S8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0S8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0S8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0S8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0S8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0S8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0S8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0S8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0S8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H7C0S8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0S8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0S8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0S8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0S8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0S8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0S8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0S8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0S8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0S8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H7C0S8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0S8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0S8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0S8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0S8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0S8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0S8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0S8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0S8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0S8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0S8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0S8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0S8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0S8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0S8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0S8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0S8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H7C0S8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
H7C0S8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
H7C0S8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0S8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0S8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0S8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0S8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0S8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0S8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0S8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0S8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0S8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0S8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0S8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0S8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0S8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0S8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0S8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H7C0S8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0S8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0S8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0S8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0S8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0S8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0S8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0S8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0S8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0S8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0S8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0S8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
H7C0S8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0S8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0S8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0S8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H7C0S8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms