Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PALM3A6NDB9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PALM3A6NDB9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALM3A6NDB9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms