Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
TRAPPC8Q9Y2L5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.82■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.82■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.8■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.78■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TRAPPC8Q9Y2L5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRAPPC8Q9Y2L5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms