Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SRP68Q9UHB9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms