Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms