Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATRIPQ8WXE1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms